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De nouvelles séquences de puces de silicium complètent le génome en trois heures – High-teK.ca

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Un nouveau type de puce de silicium mis au point par des chercheurs de l’Université de Glasgow, en Écosse, révolutionne le séquençage de l’ADN. En seulement trois heures, cette nouvelle puce – appelée Ion Torrent – a séquencé avec succès le génome d’une souche d’E. coli qui a récemment tué 37 personnes en Europe. Contrairement au séquençage génétique conventionnel qui nécessite le marquage et la photographie de gènes individuels, un à la fois – un processus qui prend des jours pour les bactéries et des semaines ou des mois pour les cellules plus complexes – cette nouvelle puce traite l’ADN de manière massivement parallèle.

Une puce Ion Torrent est un capteur avec des millions de « puits » qui sont inondés avec l’échantillon d’ADN par une machine de génome personnel ionique (PGM), et programmés pour mesurer les changements infimes d’acidité/alcalinité causés par l’action de la polymérase sur nucléotides. La puce, en d’autres termes, est un ensemble massif de capteurs capables de mesurer le changement de pH provoqué par la libération d’un seul ion hydrogène.

De nouvelles séquences de puces de silicium complètent le génome en trois heures
Non seulement Ion Torrent accélère massivement le processus de séquençage – il peut faire correspondre des millions de nucléotides en quelques minutes – mais il diminue également le coût de la génomique à un point où presque tous les laboratoires peuvent se permettre de séquencer des gènes. Ion Torrent peut être fabriqué avec une lithographie au silicium standard, la machine de laboratoire elle-même est relativement bon marché – 50 000 $, contre des millions pour les machines de séquençage conventionnelles – et le meilleur de tous, la machine peut être utilisée sans formation spéciale.

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En ce qui concerne les implications du séquençage de gènes bon marché et démocratisé, ne cherchez pas plus loin que d’énormes améliorations dans presque tous les domaines de la vie humaine. Lorsqu’une personne tombe malade, Ion Torrent nous permet de diagnostiquer la souche exacte du virus, puis de la traiter avec des médicaments spécialisés plutôt qu’avec des antibiotiques à large spectre. Ion Torrent nous donnera un moyen simple et bon marché de découvrir des anomalies génétiques en nous-mêmes et chez nos enfants à naître. Si vous pensiez que la médecine moderne avait déjà le dessus sur les maladies de l’esprit et du corps, vous n’avez encore rien vu.

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