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Application de l’algorithme PageRank de Google à l’univers moléculaire – High-teK.ca

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Un chimiste informatique de l’Université de l’État de Washington a adapté l’algorithme de recherche séminal de Google, PageRank, de sorte qu’au lieu de cartographier des milliards de pages Web, il cartographie les formes et les réactions chimiques de quadrillions de molécules.

Dans l’algorithme de PageRank traditionnel, la « valeur » d’une page Web augmente à mesure que davantage de sites y renvoient, mais le PageRank du site source est également important. Par exemple, si High-teK.ca reçoit un lien du New York Times, notre PageRank augmentera beaucoup, mais un lien de votre blog personnel n’aura pas beaucoup d’effet. En fin de compte, le PageRank a été détruit par les bombardements de Google, où des crétins SEO infâmes créeraient des milliers de sites factices qui augmenteraient artificiellement le classement d’un vrai site. Google utilise toujours quelque chose de similaire au PageRank, mais l’algorithme est sans aucun doute beaucoup plus complexe et intelligent.

Les liaisons hydrogène dans l'eauRetour à la Découverte de l’État de Washington. Aurora Clark, avec le financement du département américain de l’énergie et en collaboration avec superordinateurs aux Pacific Northwest Laboratories, a essentiellement pris le PageRank et l’a appliqué aux liaisons hydrogène dans l’eau. Comme vous le savez probablement, une molécule d’eau est H2O ; deux atomes d’hydrogène attachés à un atome d’oxygène. Il s’agit d’une page Web en ce qui concerne le PageRank de Clark. Dans l’eau, ces atomes d’hydrogène peuvent former de multiples liaisons avec d’autres molécules d’eau. En d’autres termes, une page Web moléculaire peut être connectée à de nombreuses autres pages Web. Selon le nombre et le type de liaisons hydrogène d’une molécule d’eau, le PageRank final sera différent. Si vous avez besoin de plus de précisions, regardez la vidéo ci-dessous.

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Pourquoi est-ce important? Parce que le PageRank d’une molécule affecte la façon dont elle agira dans une réaction chimique – et l’eau est impliquée dans presque tous les processus biologiques. En comprenant comment un réseau de trillions de molécules interagit, les scientifiques peuvent produire des modèles beaucoup plus précis de réactions chimiques. En fin de compte, cet algorithme moléculaire PageRank pourrait même aider à la conception de médicaments, à la compréhension du mauvais repliement des protéines (qui est censé causer certaines maladies dégénératives) et à l’analyse des polluants radioactifs (dont la Washington State University est spécialisée).

Ce n’est pas la première fois que PageRank est utilisé en dehors du moteur de recherche de Google, d’ailleurs. L’année dernière, nous avons couvert des scientifiques espagnols qui utilisé le PageRank sur un réseau quantique. Il a également été utilisé pour analyser les chaînes alimentaires et les réseaux dans les écosystèmes, l’importance des revues scientifiques (combien d’articles « liens » vers une revue), et même la popularité des espaces et des rues dans les villes.

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